私も同様の問題が発生しました。
PC起動直後に発生したので、MDIE/78とは違う問題と思います。
ためしに調べたところ、HKEY_CURRENT_USER￥Software\MIDE2の「CloseHistoryPIDLs」キーを削除すると正常に動作するようになりました。

このバグがすごい気になる。しかし忙しい。これはかなり大間違いをしているのかもしれない。